Herb Mickun autorstwa artysty Arvydasa Každailisa na niebieskim tle przedstawia srebrną, falistą wstążkę i trzy złote siedmiokątne gwiazdy.
Kolor tarczy herbu ma symbolizować nie tylko piękną przyrodę, ale też mądrość. Srebrna wstążka nawiązuje do rzeki płynącej przez Mickuny – Wilenki. Po części falująca wstążka przypomina też pierwszą literę nazwy miejscowości. Trzy gwiazdy natomiast mają symbolizować trzech wybitnych absolwentów Uniwersytetu Wileńskiego, niegdyś mieszkających w Mickunach – Stanisława Morawskiego, Edwarda Pacewicza i Augusta Ludwika Bécu.
Herb Mickun zatwierdzony został 13 września 2013 roku na mocy dekretu Nr. 1K-1561.
