Na tym etapie walczy 16 drużyn, z których dokładnie połowa trafi do 1/8 finału. Polonia Wilno trafiła na przeciwnika z Szawel, trzecioligowy „Savanoris”. Mecze mają się odbyć w dniach 24-25 września.
Wszystkie pary III etapu:
„Klaipėdos Granitas” (Kłajpeda) I liga – „Šilutė” (Szyłokarczma) I liga
„Savanoris” (Szawle) III liga – Polonia (Wilno) I liga
„TAIP” (Wilno) III liga – „Spyris” (Kowno) I liga
„Saulininkas” (Szawle) III liga – Tauras (Taurogi) A liga
„Lokomotyvas” (Radziliwiszki) I liga – „Trakai” (Troki) I liga
„Nevėžis” (Kiejdany) I liga – „Lietava” (Janowo) I liga
„Kupsc” (Szawle) III liga – „Palanga” (Połąga) I liga
MRU (Wilno) II liga – „Švyturys” (Mariampol) III liga