Kościół św. Rafała jest tradycyjnym miejscem modlitwy za ofiary zbrodni katyńskiej. Właśnie w tej świątyni znajduje się tablica katyńska, umieszczona tam w 2008 r. z inicjatywy Jerzego Surwiły, wieloletniego dziennikarza „Kuriera Wileńskiego” i badacza zbrodni katyńskiej.
Widocznym znakiem pamięci o ofiarach był biało-czerwony wieniec i portret pary prezydenckiej, Marii i Lecha Kaczyńskich.
10 kwietnia 2010 roku w katastrofie pod Smoleńskiem w drodze na oficjalne uroczystości 70. rocznicy Zbrodni Katyńskiej zginęło 96 osób: prezydent RP Lech Kaczyński z małżonką, ostatni prezydent RP na uchodźstwie Ryszard Kaczorowski, wicemarszałkowie Sejmu i Senatu, grupa parlamentarzystów, dowódcy wszystkich rodzajów Sił Zbrojnych RP, pracownicy Kancelarii Prezydenta, szefowie instytucji państwowych, duchowni, przedstawiciele ministerstw, organizacji kombatanckich i społecznych oraz osoby towarzyszące, a także załoga samolotu.
